Ensamblaje y anotación de genomas bacterianos.

Ensamblaje y anotación de genomas bacterianos.

Descripción breve: En este curso se realizará una introducción al procesamiento de datos de secienciación de genomas bacterianos, desde el control de calidad de las secuencias obtenidas hasta la anotación y exploración de los resultados. 

El curso tratará los siguientes puntos:

1. Control de calidad y procesamiento de datos genómicos (Programas: PrinSeq, PEAR)
2. Ensamblaje de genomas con múltiples parámetros (SPAdes, A5 pipeline, QUAST)
3. Anotación automática de genes ab initio y por homología (Prokka, EggNOG-Mapper)
4. Exploración de resultados en exploradores de genomas (Artemis Comparison Tool, Geneious Basic)

Tutor: Dr. Eduardo Castro. 

Doctor en Ciencias Biológicas de The George Washimgton University. Profesor investigador en la Universidad Andres Bello. Su tema de interés es el estudio de diversidad y patrones genéticos en el tiempo y el espacio en un contexto evolutivo.

Área: Genética, genómica.

Nivel: Usuario Medio/Pregrado/Posgrado

Fecha: Sábado 27 de Agosto

Requerimientos: Conocimientos fundados de genética y computación.

Lugar:  Sala zócalo 2 (o ZO5) (, piso -1, . Edificio 210, Facultad de Ciencias Biológicas, Pontificia Universidad Católica deChile. Portugal 49

Horario: 9:00 – 18:00

Cupos: 15

Si lo desean, los alumnos pueden llevar sus propios computadores.